Единомышленники основали монастырь в конце XVI века при царе Фёдоре Иоановиче. По преданию, основателем обители считается «престарелый отставной служилый человек по имени Корнилий» с тремя соратниками. В Смутное время крепость Валуйка и монастырь были разорены, церкви осквернены и разрушены. В 1613 году по указу царя Михаила Фёдоровича Романова Валуйский монастырь был восстановлен. Утрата царских грамот, как исторических первоисточников, привела к тому, что в дальнейшем утвердилось предание об основании монастыря в 1613 году.
В 1906 году был заложен храм во имя Чудотворца Николая Мирликийского в память трёхсотлетия основания монастыря и царствующей династии Романовых, обретения близ храма иконы Николая Чудотворца. Об этом свидетельствуют плиты с памятными записями об этом грандиозном событии.
Свято-Николаевский трёхпрестольный собор – самое впечатляющее из зданий знаменитого когда‑то Валуйского монастыря. Высота его с крестом составляла 55,5 метров, глубина фундамента- 4 метра. Пятиглавый храм был украшен снаружи гипсовыми украшениями — изображениями Христа, Богоматери, ангелов, а между окон размещены 12 фигур Апостолов. Вызолоченные купола и крыши отделаны «в чашку и под чешую». Иконостас фаянсовый, с сочетанием блеска, золота, эмалей. Стоимость храма по тем временам составляла 200 тысяч рублей, а вмещал он 3 тысячи человек. На его освещении в 1913 году присутствовало более 50 тыс. паломников, на берегу Оскола накрыли стол на 3 тыс. человек, а вечером был даже фейерверк — диковинка для провинции по тем временам.
В процветающем состоянии Валуйский Успенский монастырь находился вплоть до революции 1917 года. Затем монастырь пришёл в упадок, монахи репрессированы.
Последний настоятель архимандрит Игнатий Бирюков был приговорен к 10 годам исправительно-трудовых лагерей – сначала на север страны, а затем – 1931 году — в Казахстан. Здесь, в Казахстане, 27 сентября 1932 года – на праздник Воздвижения Креста Господня — архимандрит Игнатий предал свой дух Богу.
В 1924 году Валуйский Успенский Николаевский монастырь был официально закрыт. С 1935 года территория монастыря занята детской воспитательной колонией МВД.
С первых дней Великой Отечественной войны воспитанники колонии были эвакуированы в город Куйбышев. А на территории колонии располагались итальянские части, конюшни для немецких лошадей и лагерь для пленных.
После освобождения Валуек в марте 1944 года воспитанники и сотрудники колонии вернулись из эвакуации. В колонии выпускали центробежные консольные насосы и печное литье: колосниковую решетку, глухие печные плиты. В 2003 году литейное производство было ликвидировано и организован производственный участок по изготовлению строительных блоков и тротуарной плитки. На данный момент на территории бывшего монастыря находится женская исправительная колония №9.
Реставрационные работы по восстановлению Свято-Николаевского собора начались в 2007 году. В первой половине августа 2009 года были освящены и установлены купола. 4 сентября 2011 года в воскресный день архиепископ Белгородский и Старооскольский Иоанн (ныне митрополит) совершил торжественное освящение возрождения руин четырёхпрестольного Свято-Николаевского собора, бывшего Успенско-Николаевского мужского монастыря города Валуйки.
В нижнем храме «Во имя Всех Святых в земле Российской просиявших» оборудована экспозиция, посвящённая истории Валуйского Успенского Николаевского мужского монастыря, рабочий кабинет и жилая келья настоятеля, трапезная.
Когда мы возрождаем святыни, главной целью является не только восстановление их внешнего облика. Это, безусловно, тоже немаловажно, ведь облик наших национальных святынь несет в себе частицу духовной и культурной традиции нашего народа. В первую очередь святыни восстанавливаются для того, чтобы стать местом духовного возрождения людей, потому что опыт созерцания святыни, как ничто другое, влияет на состояние человеческого сердца.
Екатерина Шубина, научный сотрудник